一名前UBC博士后研究员带领一个国际研究团队重新分析了所有公共RNA测序数据，发现了比此前已知的几乎十倍的RNA病毒，包括一些意想不到的地方的一些新冠病毒物种。
这个行星级别的RNA病毒数据库可以帮助为快速识别病毒向人类蔓延以及影响牲畜、作物和濒危物种的病毒铺平道路。
Artem Babaian博士(他/他)是塞拉图斯项目合作的幕后黑手。上周，他们在著名的科学杂志《自然》上发表了这一惊人的研究结果。
Babaian说，通过与云创新中心(UBC和亚马逊网络服务的公共/私人合作)的合作，Serratus项目能够在AWS上建立一个“非常强大”的超级计算机，相当于22500个cpu。
这台超级计算机从世界各地的570万个生物样本中读取了2000万gb的公开基因序列数据，寻找表明存在RNA病毒的特定基因。这些样本被收集并在世界研究界免费分享了13年，包括从冰核样本到动物粪便的所有东西。
世界测序数据地图。信贷:锯肌项目
Serratus项目的研究人员发现了13.2万种RNA病毒(此前已知的只有1.5万种)和9种新冠病毒。Babaian估计，如果没有CIC和AWS云，一台传统超级计算机需要一年多的时间和数十万美元才能完成这项分析所需的2000年的CPU时间。塞拉图斯只用了11天，花费了2.4万美元。
“我们正在进入一个新的时代，了解自然界病毒的基因和空间多样性，以及各种各样的动物如何与这些病毒接触。希望如果像sars - cov -2这样的新型冠状病毒再次出现，我们不会措手不及。这些病毒更容易被识别，它们的自然宿主也能更快地被找到。真正的目标是及早发现这些感染，使它们永远不会成为大流行，”Babaian说，他拥有UBC的医学遗传学博士学位，现在是剑桥大学的班廷研究员。
“如果病人出现不明原因的发烧，一旦血液序列被确定，你现在可以将人类身上的未知病毒与一个更大的现有病毒数据库联系起来。例如，如果一个病人在圣路易斯出现了未知来源的病毒感染，你现在可以在大约两分钟内搜索数据库，并将该病毒与2012年撒哈拉以南非洲的骆驼样本联系起来。”
32岁的Babaian一直在进行BC癌症的基因研究，当COVID-19大流行袭来时，他改变了策略。
巴巴安说，这项工作最初是一个“有趣的业余项目”，开始于2020年3月3日，当时他和他的攀岩伙伴朋友，UBC大学工程学学生杰夫·泰勒，“在餐巾背面”勾勒出了这个想法，巴巴安说。
“我应该留下那张餐巾纸，”他说。
不久之后Babaian向UBC的云创新中心寻求帮助。塞拉特斯山(Serratus)诞生了，它以不列颠哥伦比亚省坦塔罗斯山脉的塞拉特斯山(Serratus Mountain)命名，他和泰勒在2020年爬山时看到了这座山。
Babaian回忆说，当他坐在妻子的护理椅上时，第一个结果开始在他的笔记本电脑上闪现，表明Serratus不仅在工作，而且在以难以理解的速度生成数据。
“那可能是我一生中最激动人心的科学时期，”他说。“乐趣有两种类型。1型是微笑和有趣。二型是你在做的时候很痛苦，但记忆却很好，就像攀岩一样。在许多方面，Serratus是2型乐趣。你只需要相信它会成功。”
Babaian表示，如果没有UBC云创新中心的支持，他不可能完成这项工作。
他说:“云创新中心确实在那里为我们打开了大门。”“我们有了一个想法，他们从他们的网络中请来了专家来实现它。现在，全球社会可以从所有这些以前未开发的研究中受益。”
“Artem带着创新的眼光来找我们。云创新中心的力量在于，我们将来自UBC的内部创新和技术团队与来自亚马逊网络服务的团队配对，”UBC云创新中心主任Marianne Schroeder说。“我们非常荣幸能够支持这一愿景的实现;我们所做的就是帮助找到解决复杂问题的技术方案。”
该中心于2020年1月大流行之前成立，支持以社区卫生和福祉为重点的挑战。到目前为止，该团队已经发布了20多个项目，包括参考体系结构和部署指南，所有这些都是开放源码的。
亚马逊网络服务中心(Centre for Amazon Web Services)负责人科勒尔•肯尼特(Coral Kennett)表示:“虽然我们所知的公共云已经存在了15年，但过去几年亚马逊网络服务的创新确实让基因组学研究以一种新的方式成为可能。”“我们能够让Artem以几美分的价格获得计算能力。我们高度鼓励研究界向云创新中心提交他们的项目和想法，这样更多的创新才能让社区受益。”
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